L’axe HPI (Host–Pathogen Interactions) rassemble des équipes qui s’intéressent plus particulièrement à analyser les interactions précoces et les dynamiques qui se mettent en place entre les micro-organismes, principalement les bactéries et les levures, et leurs environnements biologiques. Cet axe place les glycanes au centre des mécanismes fondamentaux de la vie microbienne et des processus de l'infection.
L’ambition de l’axe HPI est de développer une étude intégrée et transversale de ces interactions en combinant la glycobiologie, la microbiologie, la biophysique, l’imagerie et la modélisation, le tout inscrit dans une perspective « One Health ». Le programme scientifique s'articule autour de trois piliers majeurs :
Ces approches convergent vers des objectifs cliniques et translationnels visant le développement d’outils de diagnostic basés sur de nouveaux biomarqueurs glycosylés.